L’église paroissiale de Beptenoud est mentionnée en 1172 dans les possessions de l’abbaye de Saint-Chef, relevant du prieuré Saint-Hyppolyte de Crémieu.
Après la révolution, une seule paroisse est maintenue, à VILLE, en 1837.
Une croix dédiée à Sainte Philomène, datée de 1843, est érigée face à l’entrée de l’église. Le cimetière a été utilisé jusqu’en 1891.
A l’origine, l’église était entourée de son cimetière. La clôture est restée en place ainsi que quelques pierres tombales. Cetaines ont été réemployées pour marquer la bordure du chemin d’accès à l’église.
La nef est lambrissée et fermée à l’est par un mur dans lequel s’ouvre un arc triomphal qui délimite le coeur faiblement voûté en cul-de-four.
Elle est caractéristique des églises romanes du canton : nef unique, chevet de petite taille surmonté d’un clocher-mur, portail au linteau reposant sur des coussinets moulurés.
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